Serviciul Asistenţă Participanţi din cadrul TRANSFOND a fost lansat în aprilie 2005, şi are rolul unui punct unic de contact pentru toţi participanţii la Sistemul Electronic de Plăţi, respectiv instituţiile bancare din România şi Ministerul Finanţelor Publice, cărora TRANSFOND le furnizează servicii de asistenţă în legătură cu orice tip de probleme ar întâmpina în utilizarea SEP. În 2006 TRANSFOND a demarat un proiect care pune la dispoziţia utilizatorilor direcţi ai sistemului de plăţi, o nouă aplicaţie software pentru Asistenţa Participanţilor.
Noua aplicaţie software pentru Asistenţa Participanţilor, intrată în producţie la începutul anului 2007, este o soluţie Remedy, menită să înlesnească automatizarea proceselor de asistenţă şi o mai bună gestionare a acestora.
Problemele întâmpinate în exploatarea SEP pot fi semnalate în zilele lucrătoare, în intervalul orar 08.00-18.00. Noua aplicaţie prezintă o serie de avantaje, cum ar fi: